故事发生在一个魔法人类濒临灭绝的世界。最高等级的力量从使用剑变成使用魔法，然后变成使用火器。《魔法花园指南》中的主人公草薙·肖是一个训练有素的专业组织，专门打击剩余的魔法威胁。他是一个完全不用武器，只用刀子对付敌人的另类。由他领导的第35个实验小组也被称为“杂鱼小组”，顾名思义，就是由一群劣等学生拼凑而成的小组。一天，拥有“猎巫人”资格的超级精英枪手凤凰樱花加入了队伍。在带领团队成员找回魔法向导遗产的任务中，学院开始了一场魔法表演。