奈叶(田村由加莉配音)原本是一个小学三年级的普通女孩，但由于意外地遇到了来自不同世界的尤诺，她变成了一个神奇的女孩，并投身于传承之战。最后一次事件后，奈叶告别了与他结下深厚友谊的钳工(水树奈奈配音)，回到平静的日常生活，接受魔法训练，以防备敌人的下一次猛烈攻击。一天，一个神秘的魔法出现在海明市。这一不寻常的现象引起了奈叶的注意。果然，奈叶被红头发的魔法女孩维塔(真田麻美配音)攻击了。令奈叶惊讶的是，维塔突然摧毁了奈叶的坚固防御。幸运的是，菲特及时的出现把奈叶从灾难中救了出来，而维塔的出现意味着一个阴谋正在秘密进行。